Balík: r-cran-spp (1.15.5-1) [debports]

[ Zdroj:  ]

GNU R ChIP-seq processing pipeline

R package for anlaysis of ChIP-seq and other functional sequencing data

 * Assess overall DNA-binding signals in the data and select appropriate
   quality of tag alignment.
 * Discard or restrict positions with abnormally high number of tags.
 * Calculate genome-wide profiles of smoothed tag density and save them
   in WIG files for viewing in other browsers.
 * Calculate genome-wide profiles providing conservative statistical
   estimates of fold enrichment ratios along the genome. These can be
   exported for browser viewing, or thresholded to determine regions of
   significant enrichment/depletion.
 * Determine statistically significant point binding positions
 * Assess whether the set of point binding positions detected at a
   current sequencing depth meets saturation criteria, and if does not,
   estimate what sequencing depth would be required to do so.

Ostatné balíky súvisiace s balíkom r-cran-spp

• dep: libbz2-1.0

  kvalitná knižnica na komprimáciu súborov s triedením blokov - dynamická knižnica

• dep: libc6 (>= 2.4)

  knižnica GNU C - zdieľané knižnice
  tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6-udeb

• dep: libgcc1 (>= 1:3.4)

  Balík nie je dostupný

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  štandardná knižnica C++ GNU v3

• dep: r-api-3.5

  Balík nie je dostupný

• dep: r-base-core (>= 3.5.1-1)

  jadro GNU R na štatistické výpočty a grafický systém

• dep: r-bioc-rsamtools

  GNU R binary alignment (BAM), variant call (BCF), or tabix file import

• dep: r-cran-catools

  GNU R package providing various utility functions

• dep: r-cran-rcpp

  balík GNU R na hladkú integráciu R a C++

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  komprimačná knižnica - dynamická verzia

Stiahnuť r-cran-spp

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry

Architektúra	Veľkosť balíka	Nainštalovaná veľkosť	Súbory
sparc64 (neoficiálny port)	307.6 kB	431.0 kB	[zoznam súborov]