Balík: murasaki (1.68.6-14) [debports]

[ Zdroj:  ]

homology detection tool across multiple large genomes

Murasaki is a scalable and fast, language theory-based homology detection tool across multiple large genomes. It enable whole-genome scale multiple genome global alignments. Supports unlimited length gapped-seed patterns and unique TF-IDF based filtering.

Murasaki is an anchor alignment software, which is

 * exteremely fast (17 CPU hours for whole Human x Mouse genome (with
   40 nodes: 52 wall minutes))
 * scalable (Arbitrarily parallelizable across multiple nodes using MPI.
   Even a single node with 16GB of ram can handle over 1Gbp of sequence.)
 * unlimited pattern length
 * repeat tolerant
 * intelligent noise reduction

Ostatné balíky súvisiace s balíkom murasaki

• dep: libboost-filesystem1.83.0 (>= 1.83.0)

  operácie so súborovým systémom (portabilné cesty, prechádzanie adresárov atď.) v C++

• dep: libboost-iostreams1.83.0 (>= 1.83.0)

  knižnica Boost.Iostreams

• dep: libc6 (>= 2.38)

  knižnica GNU C - zdieľané knižnice
  tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.4)

  podporná knižnica GCC

• dep: libstdc++6 (>= 14)

  štandardná knižnica C++ GNU v3

• dep: murasaki-common

  homology detection tool across multiple large genomes (common files)

Stiahnuť murasaki

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry

Architektúra	Veľkosť balíka	Nainštalovaná veľkosť	Súbory
sparc64 (neoficiálny port)	506.3 kB	13,458.0 kB	[zoznam súborov]