Balík: lagan (2.0-10) [debports]

[ Zdroj:  ]

highly parametrizable pairwise global genome sequence aligner

Lagan takes local alignments generated by CHAOS as anchors, and limits the search area of the Needleman-Wunsch algorithm around these anchors.

Multi-LAGAN is a generalization of the pairwise algorithm to multiple sequence alignment. M-LAGAN performs progressive pairwise alignments, guided by a user-specified phylogenetic tree. Alignments are aligned to other alignments using the sum-of-pairs metric.

Ostatné balíky súvisiace s balíkom lagan

• dep: libc6 (>= 2.37)

  knižnica GNU C - zdieľané knižnice
  tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.4)

  podporná knižnica GCC

• dep: libstdc++6 (>= 13.1)

  štandardná knižnica C++ GNU v3

Stiahnuť lagan

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry

Architektúra	Veľkosť balíka	Nainštalovaná veľkosť	Súbory
sh4 (neoficiálny port)	179.3 kB	1,747.0 kB	[zoznam súborov]