Balík: r-bioc-decontam (1.26.0+dfsg-2)

[ Zdroj: r-bioc-decontam  ]

identify contaminants in marker-gene and metagenomics sequencing sata

Simple statistical identification of contaminating sequence features in marker-gene or metagenomics data. Works on any kind of feature derived from environmental sequencing data (e.g. ASVs, OTUs, taxonomic groups, MAGs,...). Requires DNA quantitation data or sequenced negative control samples.

Ostatné balíky súvisiace s balíkom r-bioc-decontam

• dep: r-api-4.0

  virtuálny balík poskytovaný balíkom r-base-core

• dep: r-api-bioc-3.20

  virtuálny balík poskytovaný balíkom r-bioc-biocgenerics

• dep: r-cran-ggplot2 (>= 2.1.0)

  implementácia Gramatiky grafiky

• dep: r-cran-reshape2 (>= 1.4.1)

  flexibilná zmena tvaru dát - reboot balíka reshape

• sug: r-bioc-biocstyle

  standard styles for vignettes and other Bioconductor documents

• sug: r-bioc-phyloseq

  GNU R handling and analysis of high-throughput microbiome census data

• sug: r-cran-knitr

  balík GNU R na dynamickú tvorbu zostáv pomocou Literate Programming

• sug: r-cran-rmarkdown

  convert R markdown documents into a variety of formats

Stiahnuť r-bioc-decontam

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry

Architektúra	Veľkosť balíka	Nainštalovaná veľkosť	Súbory
all	205.9 kB	285.0 kB	[zoznam súborov]