Balík: ampliconnoise (1.29-13) [debports]

[ Zdroj:  ]

removal of noise from 454 sequenced PCR amplicons

AmpliconNoise is a package of applications to clean up high-throughput sequence data. It consists of three main parts:

Pyronoise - does flowgram-based clustering to spot misreads SeqNoise - removes PCR point mutations Perseus - removes PCR chimeras without the need for a set of reference sequences

Previously there was a standalone "Pyronoise" by the same authors and this package includes an updated version. There is also a "Denoiser" in Qiime which is related but distinct.

Ostatné balíky súvisiace s balíkom ampliconnoise

• dep: libc6 (>= 2.34)

  knižnica GNU C - zdieľané knižnice
  tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6-udeb

• dep: libgsl28 (>= 2.8+dfsg)

  GNU Scientific Library (GSL) - balík knižnice

• dep: libopenmpi3t64 (>= 4.1.6)

  knižnica na vyskokovýkonné odovzdávanie správ - zdieľaná knižnica

• dep: mafft

  Multiple alignment program for amino acid or nucleotide sequences

• rec: openmpi-bin

  knižnica na vyskokovýkonné odovzdávanie správ - spustiteľné súbory

Stiahnuť ampliconnoise

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry

Architektúra	Veľkosť balíka	Nainštalovaná veľkosť	Súbory
ppc64 (neoficiálny port)	1,085.7 kB	2,589.0 kB	[zoznam súborov]