Balík: libhts3 (1.17+ds-1) [debports]

[ Zdroj:  ]

C library for high-throughput sequencing data formats

HTSlib is an implementation of a unified C library for accessing common file formats, such as SAM (Sequence Alignment/Map), CRAM and VCF (Variant Call Format), used for high-throughput sequencing data, and is the core library used by samtools and bcftools. HTSlib only depends on zlib. It is known to be compatible with gcc, g++ and clang.

HTSlib implements a generalized BAM (binary SAM) index, with file extension ‘csi’ (coordinate-sorted index). The HTSlib file reader first looks for the new index and then for the old if the new index is absent.

Ostatné balíky súvisiace s balíkom libhts3

• dep: libbz2-1.0

  kvalitná knižnica na komprimáciu súborov s triedením blokov - dynamická knižnica

• dep: libc6 (>= 2.34)

  knižnica GNU C - zdieľané knižnice
  tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6-udeb

• dep: libcurl3-gnutls (>= 7.18.0)

  jednoducho použiteľná klientská knižnica na prenos URL - verzia GnuTLS

• dep: libdeflate0 (>= 1.0)

  fast, whole-buffer DEFLATE-based compression and decompression

• dep: libhtscodecs2 (>= 1.3.0)

  Custom compression for CRAM and others

• dep: liblzma5 (>= 5.1.1alpha+20120614)

  komprimačná knižnica formátu XZ

• dep: libssl3 (>= 3.0.0)

  sada nástrojov SSL (Secure Sockets Layer) - zdieľné knižnice

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  komprimačná knižnica - dynamická verzia

Stiahnuť libhts3

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry

Architektúra	Veľkosť balíka	Nainštalovaná veľkosť	Súbory
riscv64 (neoficiálny port)	389.8 kB	781.0 kB	[zoznam súborov]