Balík: tombo (1.5.1-4) [debports]

[ Zdroj:  ]

identification of modified nucleotides from raw nanopore sequencing data

Tombo is a suite of tools primarily for the identification of modified nucleotides from nanopore sequencing data. Tombo also provides tools for the analysis and visualization of raw nanopore signal.

Ostatné balíky súvisiace s balíkom tombo

• dep: cython3

  C-Extensions for Python 3

• dep: libc6.1 (>= 2.36)

  knižnica GNU C - zdieľané knižnice
  tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6.1-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 4.2)

  podporná knižnica GCC

• dep: python3

  interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

  dep: python3 (<< 3.12)

  dep: python3 (>= 3.11~)

• dep: python3-h5py

  general-purpose Python interface to hdf5

• dep: python3-mappy

  Python3 interface minimap2

• dep: python3-numpy

  Fast array facility to the Python language (Python 3)

• dep: python3-pkg-resources

  objavovanie balíkov a prístup k zdrojom prostredníctvom pkg_resources

• dep: python3-scipy

  vedecké nástroje pre Python 3

• dep: python3-tqdm

  fast, extensible progress bar for Python 3 and CLI tool

• rec: python3-pyfaidx

  efficient random access to fasta subsequences for Python 3

• rec: python3-rpy2

  Python3 interface to the GNU R language and environment (version 2)

Stiahnuť tombo

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry

Architektúra	Veľkosť balíka	Nainštalovaná veľkosť	Súbory
ia64 (neoficiálny port)	432.8 kB	1,618.0 kB	[zoznam súborov]