Balík: blasr (5.3.5+dfsg-6 a iné) [debports]

[ Zdroj:  ]

mapping single-molecule sequencing reads

Basic local alignment with successive refinement (BLASR) is a method for mapping single-molecule sequencing reads against a reference genome. Such reads are thousands of bases long, with divergence between them and the genome being dominated by insertion and deletion error.

Ostatné balíky súvisiace s balíkom blasr

• dep: libblasr5.3.5 (>= 5.3.5+dfsg)

  tools for aligning PacBio reads to target sequences

• dep: libc6.1 (>= 2.37)

  knižnica GNU C - zdieľané knižnice
  tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6.1-udeb

• dep: libhdf5-cpp-103-1 (>= 1.10.5)

  HDF5 - C++ runtime files - serial version

• dep: libpbbam2.4.0 (>= 2.4.0+dfsg)

  Pacific Biosciences binary alignment/map (BAM) library

• dep: libpbcopper2.3.0 (>= 2.3.0+dfsg)

  data structures, algorithms, and utilities for C++ applications

• dep: libpbseq (>= 5.3.5+dfsg-4~)

  library for analyzing PacBio sequencing data

• dep: libstdc++6 (>= 13.1)

  štandardná knižnica C++ GNU v3

• dep: libunwind8

  nnižnica na určenie na určenie postupnosti volania programu - dynamické súbory

Stiahnuť blasr

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry

Architektúra	Verzia	Veľkosť balíka	Nainštalovaná veľkosť	Súbory
ia64 (neoficiálny port)	5.3.5+dfsg-6+b4	271.0 kB	1,226.0 kB	[zoznam súborov]