Balík: r-bioc-pwalign (1.2.0-1)

[ Zdroj: r-bioc-pwalign  ]

Experimentálny balík

Upozornenie: Tento balík pochádza z distribúcie experimental. To znamená, že je pravdepodobne nestabilný alebo môže dokonca spôsobiť stratu údajov. Predtým, než ho začnete používať sa prosím pozrite do záznamu zmien a ďalšej možnej dokumentácie.

Perform pairwise sequence alignments

The two main functions in the package are pairwiseAlignment() and stringDist(). The former solves (Needleman-Wunsch) global alignment, (Smith-Waterman) local alignment, and (ends-free) overlap alignment problems. The latter computes the Levenshtein edit distance or pairwise alignment score matrix for a set of strings.

Ostatné balíky súvisiace s balíkom r-bioc-pwalign

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  knižnica GNU C - zdieľané knižnice
  tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

  dep: libc6 (>= 2.27) [riscv64]

  dep: libc6 (>= 2.4) [mips64el, ppc64, s390x, sparc64]

• dep: r-api-4.0

  Balík nie je dostupný

• dep: r-api-bioc-3.20

  virtuálny balík poskytovaný balíkom r-bioc-biocgenerics

• dep: r-bioc-biocgenerics

  generic functions for Bioconductor

• dep: r-bioc-biostrings (>= 2.71.5)

  GNU R string objects representing biological sequences

• dep: r-bioc-iranges

  GNU R low-level containers for storing sets of integer ranges

• dep: r-bioc-s4vectors

  BioConductor S4 implementation of vectors and lists

• dep: r-bioc-xvector

  BioConductor representation and manpulation of external sequences

• sug: r-cran-runit

  GNU R package providing unit testing framework

Stiahnuť r-bioc-pwalign

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry

Architektúra	Veľkosť balíka	Nainštalovaná veľkosť	Súbory
amd64	737.1 kB	1,105.0 kB	[zoznam súborov]
arm64	735.5 kB	1,145.0 kB	[zoznam súborov]
mips64el	734.1 kB	1,153.0 kB	[zoznam súborov]
ppc64 (neoficiálny port)	739.1 kB	1,209.0 kB	[zoznam súborov]
ppc64el	737.6 kB	1,145.0 kB	[zoznam súborov]
riscv64	736.5 kB	1,089.0 kB	[zoznam súborov]
s390x	736.8 kB	1,109.0 kB	[zoznam súborov]
sparc64 (neoficiálny port)	732.3 kB	2,042.0 kB	[zoznam súborov]