Balík: poretools (0.6.0+dfsg-3)

[ Zdroj: poretools  ]

toolkit for nanopore nucleotide sequencing data

poretools is a flexible toolkit for exploring datasets generated by nanopore sequencing devices from MinION for the purposes of quality control and downstream analysis. Poretools operates directly on the native FAST5 (a variant of the HDF5 standard) file format produced by ONT and provides a wealth of format conversion utilities and data exploration and visualization tools.

Ostatné balíky súvisiace s balíkom poretools

• dep: python

  interaktívny vysokoúrovňový objektovo orientovaný jazyk (verzia python2)

• dep: python-h5py

  rozhranie k hdf5 na všeobecné účely pre Python 2

• dep: python-matplotlib

  systém v Pythone na vykresľovanie v štýle podobnom Matlabu

• dep: python-pandas

  údajové štruktúry „relačných“ dát alebo dát „s označením“

• dep: python-pkg-resources

  objavovanie balíkov a prístup k zdrojom prostredníctvom pkg_resources

• dep: python-seaborn

  statistical visualization library for Python

Stiahnuť poretools

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry

Architektúra	Veľkosť balíka	Nainštalovaná veľkosť	Súbory
all	18.7 kB	116.0 kB	[zoznam súborov]