Balík: openbabel (2.4.1+dfsg-3)

[ Zdroj: openbabel  ]

nástroje chemickej sady nástrojov - nástroje príkazového riadka

Open Babel je sada chemických nástrojov navrhnutých tak, aby hovorili mnohými jazykmi chemických dát. Umožňuje vyhľadávať, konvertovať, analyzovať alebo ukladať dáta molekulárneho modelovania, chémie, pevných materiálov, biochémie a zo súvisiacich oblastí. Medzi jeho vlastnosti patria:

 * pridávanie a odoberanie vodíkov
 * podpora molekulárnej mechaniky
 * podpora syntaxe SMARTS na hľadanie zodpovedajúcich molekúl
 * automatické vnímanie vlastností (cykly, väzby, hybridizácia,
   aromatickosť)
 * flexibilný typovač atómov a vnímanie viacnásobných väzieb z atómových
   súradníc
 * Gasteiger-Marsiliho výpočet čiastočného náboja

Medzi formáty, ktoré Open Babel podporuje patria PDB, XYZ, CIF, CML, SMILES, MDL Molfile, ChemDraw, Gaussian, GAMESS, MOPAC a MPQC.

Tento balík obsahuje nasledovné nástroje:

 * babel: konverzia medzi rozličnými formátmi chemických súborov
 * obenergy: výpočet energie molekuly
 * obgen: tvorba 3D súradníc molekuly
 * obminimize: optimalizácia geometrie, minimalizácia energie molekuly
 * obgrep: program na hľadanie molekúl používajúci vzory SMARTS
 * obprop: výpis štandardných vlastností molekúl
 * obfit: superpozícia dvoch molekúl v závislosti na vzore
 * obrotamer: tvorba súradníc konformérov/rotamérov
 * obconformer: tvorba nízkoenergetických konformérov
 * obchiral: výpis informácií o chemickej chiralite
 * obrotate: rotácia dihedrélneho uhla molekúl v dávkovom režime
 * obprobe: tvorba mriežky elektrostatickej sondy

Značky: Pole: Chémia, Implementované v: C++, User Interface: interface::commandline, role::program, Scope: Utility, Purpose: Konverzia dát

Ostatné balíky súvisiace s balíkom openbabel

• dep: libc6 (>= 2.4)

  knižnica GNU C - zdieľané knižnice
  tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6-udeb

• dep: libgcc1 (>= 1:3.0)

  podporná knižnica GCC

• dep: libgomp1 (>= 4.2.1)

  podporná knižnica GCC OpenMP (GOMP)

• dep: libopenbabel5

  sada chemických nástrojov - knižnica

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  štandardná knižnica C++ GNU v3

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  komprimačná knižnica - dynamická verzia

Stiahnuť openbabel

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry

Architektúra	Veľkosť balíka	Nainštalovaná veľkosť	Súbory
i386	125.7 kB	601.0 kB	[zoznam súborov]