Balík: emboss (6.6.0+dfsg-7 a iné)

[ Zdroj: emboss  ]

európsky balík otvoreného softvéru pre molekulárnu biológiu

EMBOSS (European Molecular Biology Open Software Suite) je analytický balík vyvinutý špeciálne pre potreby komunity používateľov molekulárnej biológie (napr. EMBnet). Softvér automaticky pracuje s dátami v rozličných formátoch a dokonca umožňuje transparentné získavanie sekvencovaných dát z webu. Pretože s balíkom sa poskytujú aj rozsiahle knižnice, je tiež platformou umožňujúcou iným vedcom vyvíjať a vydávať softvér v pravom duchu open source. EMBOSS tiež integruje množstvo momentálne dostupných balíkov a nástrojov na analýzu sekvencií do jedného celku. EMBOSS prerušuje historický trend smerom ku komerčným balíkom softvéru.

Značky: Pole: Biológia, Bioinformatika, field::biology:molecular, implemented-in::c, User Interface: Príkazový riadok, Role: Program, Scope: scope::suite, scope::utility, Purpose: Analyzovanie, Porovnávanie, use::converting, use::editing, Organizácia dát, Searching, use::text-formatting, use::typesetting, Vizualizácia dát, Supports Format: works-with-format::TODO, works-with-format::plaintext, Works with: Need an extra tag, works-with::db, works-with::text

Ostatné balíky súvisiace s balíkom emboss

• dep: emboss-data (= 6.6.0+dfsg-7)

  data files for the EMBOSS package

• dep: emboss-lib (= 6.6.0+dfsg-7+b1)

  knižnice EMBOSS

• dep: libc6 (>= 2.15)

  knižnica GNU C - zdieľané knižnice
  tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6-udeb

• dep: libexpat1 (>= 2.0.1)

  knižnica jazyka C na syntaktickú analýzu XML - dynamické knižnice

• dep: libgd3 (>= 2.1.0~alpha~)

  grafická knižnica GD

• dep: libhpdf-2.3.0 (>= 2.3.0)

  C library for generating pdf files

• dep: libmariadb3 (>= 3.0.0)

  databáza MariaDB - klientská knižnica

• dep: libpng16-16 (>= 1.6.2-1)

  knižnica PNG - dynamická knižnica (verzia 1.6)

• dep: libpq5

  klientská knižnica PostgreSQL pre C

• dep: libssl1.1 (>= 1.1.0)

  sada nástrojov SSL (Secure Sockets Layer) - zdieľné knižnice

• dep: libx11-6

  klientská knižnica X11

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  komprimačná knižnica - dynamická verzia

• rec: dialign

  Segment-based multiple sequence alignment

• rec: primer3

  tool to design flanking oligo nucleotides for DNA amplification

• sug: clustalw

  globálne viacnásobné zarovnávanie sekvencií nukleotidov alebo peptidov

• sug: embassy

  Balík nie je dostupný

• sug: emboss-doc

  documentation for EMBOSS

• sug: emboss-test

  test files for the EMBOSS package

Stiahnuť emboss

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry

Architektúra	Verzia	Veľkosť balíka	Nainštalovaná veľkosť	Súbory
i386	6.6.0+dfsg-7+b1	1,033.5 kB	5,495.0 kB	[zoznam súborov]