Balík: brig (0.95+dfsg-2)

[ Zdroj: brig  ]

BLAST Ring Image Generator

BRIG can display circular comparisons between a large number of genomes, with a focus on handling genome assembly data.

 * Images show similarity between a central reference sequence and other
   sequences as concentric rings.
 * BRIG will perform all BLAST comparisons and file parsing automatically
   via a simple GUI.
 * Contig boundaries and read coverage can be displayed for draft genomes;
   customized graphs and annotations can be displayed.
 * Using a user-defined set of genes as input, BRIG can display gene
   presence, absence, truncation or sequence variation in a set of
   complete genomes, draft genomes or even raw, unassembled sequence data.
 * BRIG also accepts SAM-formatted read-mapping files enabling genomic
   regions present in unassembled sequence data from multiple samples to
   be compared simultaneously

Ostatné balíky súvisiace s balíkom brig

• dep: cgview

  Circular Genome Viewer

• dep: default-jre

  štandardné dynamické prostredie Java alebo kompatibilné s Javou

  alebo java7-runtime

  virtuálny balík poskytovaný balíkom default-jre, openjdk-11-jre

  alebo java8-runtime

  virtuálny balík poskytovaný balíkom default-jre, openjdk-11-jre

  alebo java9-runtime

  virtuálny balík poskytovaný balíkom default-jre, openjdk-11-jre

  alebo java10-runtime

  virtuálny balík poskytovaný balíkom default-jre, openjdk-11-jre

  alebo java11-runtime

  virtuálny balík poskytovaný balíkom default-jre, openjdk-11-jre

• dep: jarwrapper (>= 0.5)

  Spúšťa spustiteľné súbory Java .jar

• dep: libjdom1-java

  odľahčená a rýchla knižnica používajúca XML

• dep: libswing-layout-java

  rozšírenie Swing layout

Stiahnuť brig

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry

Architektúra	Veľkosť balíka	Nainštalovaná veľkosť	Súbory
amd64	111.8 kB	412.0 kB	[zoznam súborov]
arm64	111.8 kB	412.0 kB	[zoznam súborov]
armhf	111.8 kB	412.0 kB	[zoznam súborov]
i386	111.8 kB	412.0 kB	[zoznam súborov]