Balík: phybin (0.3-3)

[ Zdroj: phybin  ]

binning/clustering newick trees by topology

PhyBin is a simple command line tool that classifies a set of Newick tree files by their topology. The purpose of it is to take a large set of tree files and browse through the most common tree topologies.

It can do simple binning of identical trees or more complex clustering based on an all-to-all Robinson-Foulds distance matrix.

phybin produces output files that characterize the size and contents of each bin or cluster (including generating GraphViz-based visual representations of the tree topologies).

Ostatné balíky súvisiace s balíkom phybin

• dep: libatomic1 (>= 4.8)

  pomocná knižnica poskytujúca zabudované funkcie __atomic

• dep: libc6 (>= 2.28)

  knižnica GNU C - zdieľané knižnice
  tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6-udeb

• dep: libffi6 (>= 3.0.4)

  rozhranie k cudzím funkciám - dynamická knižnica

• dep: libgmp10

  aritmetická knižnica s viacnásobnou presnosťou

Stiahnuť phybin

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry

Architektúra	Veľkosť balíka	Nainštalovaná veľkosť	Súbory
armhf	1,779.1 kB	11,932.0 kB	[zoznam súborov]