Balík: python3-biopython (1.73+dfsg-1)

[ Zdroj: python-biopython  ]

knižnica na bioinformatiku implementovaná v jazyku Python 3

Projekt Biopython je medzinárodné združenie vývojárov slobodne dostupných nástrojov v jazyku Python na výpočtovú molekulárnu biológiu.

Je to distribuovaná spolupráca na vývoji knižníc a aplikácií v jazyku Python, ktoré pokrývajú potreby súčasnej a budúcej práce v bioinformatike. Zdrojový kód je prístupný za podmienok licencie Biopython License, ktorá je extrémne liberálna a kompatibilná s takmer každou licenciou na svete. Projekt funguje vedľa nadácie Open Bioinformatics Foundation, ktorá projektu štedro poskytuje webový priestor a úložisko CVS.

Tento balík je cielený na Python verzie 3.

Ostatné balíky súvisiace s balíkom python3-biopython

• dep: libc6 (>= 2.17)

  knižnica GNU C - zdieľané knižnice
  tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6-udeb

• dep: python3

  interaktívny vysokoúrovňový objektovo orientovaný jazyk (predvolená verzia python3)

  dep: python3 (<< 3.8)

  dep: python3 (>= 3.7~)

• dep: python3-numpy (>= 1:1.16.0~rc1)

  schopnosti rýchlych polí do jazyka Python 3

• dep: python3-numpy-abi9

  virtuálny balík poskytovaný balíkom python3-numpy

• dep: python3-reportlab

  knižnica ReportLab na tvorbu dokumentov PDF pomocou Pythonu

• rec: ncbi-blast+

  next generation suite of BLAST sequence search tools

• rec: python-biopython-doc (= 1.73+dfsg-1)

  Documentation for the Biopython library

• sug: clustalo

  všeobecný program na viacnásobné zarovnávanie sekvencií bielkovín

• sug: clustalw

  globálne viacnásobné zarovnávanie sekvencií nukleotidov alebo peptidov

• sug: dialign

  Segment-based multiple sequence alignment

• sug: dssp

  protein secondary structure assignment based on 3D structure

• sug: emboss

  európsky balík otvoreného softvéru pre molekulárnu biológiu

• sug: fasttree

  phylogenetic trees from alignments of nucleotide or protein sequences

• sug: mafft

  Multiple alignment program for amino acid or nucleotide sequences

• sug: muscle

  Multiple alignment program of protein sequences

• sug: phylip

  package of programs for inferring phylogenies

• sug: phyml

  Phylogenetic estimation using Maximum Likelihood

• sug: prank

  Probabilistic Alignment Kit for DNA, codon and amino-acid sequences

• sug: probcons

  PROBabilistic CONSistency-based multiple sequence alignment

• sug: python3-matplotlib

  systém v Pythone na vykresľovanie v štýle podobnom Matlabu - Python 3

• sug: python3-mysqldb

  rozhranie jazyka Python k MySQL

• sug: python3-pil

  Python Imaging Library - Python3

• sug: python3-psycopg2

  modul PostgreSQL pre Python 3

• sug: python3-rdflib

  knižnica jazyka Python 3 obsahujúca RDF triple store a syntaktické analyzátory a serializátory RDF

• sug: python3-renderpm

  nízkoúrovňové vykresľovacie rozhranie pre Python

• sug: python3-scipy

  vedecké nástroje pre Python 3

• sug: python3-tk

  Tkinter - písanie aplikácií Tk v jazyku Python 3.x

• sug: raxml

  Randomized Axelerated Maximum Likelihood of phylogenetic trees

• sug: samtools

  processing sequence alignments in SAM, BAM and CRAM formats

• sug: t-coffee

  Multiple Sequence Alignment

• sug: w3-dtd-mathml

  Mathematical Markup Language V2.0 DTD

• sug: wise (>= 2.4.1-16)

  comparison of biopolymers, like DNA and protein sequences

Stiahnuť python3-biopython

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry

Architektúra	Veľkosť balíka	Nainštalovaná veľkosť	Súbory
arm64	1,246.0 kB	8,866.0 kB	[zoznam súborov]