Balík: libmems1 (1.6.0+4725-8 a iné)

[ Zdroj: libmems  ]

library to support DNA string matching and comparative genomics

libMems is a freely available software development library to support DNA string matching and comparative genomics. Among other things, libMems implements an algorithm to perform approximate multi-MUM and multi-MEM identification. The algorithm uses spaced seed patterns in conjunction with a seed-and-extend style hashing method to identify matches. The method is efficient, requiring a maximum of only 16 bytes per base of the largest input sequence, and this data can be stored externally (i.e. on disk) to further reduce memory requirements.

This package contains the dynamic library.

Značky: Role: Shared Library

Ostatné balíky súvisiace s balíkom libmems1

• dep: libboost-filesystem1.67.0

  operácie so súborovým systémom (portabilné cesty, prechádzanie adresárov atď.) v C++

• dep: libboost-iostreams1.67.0

  knižnica Boost.Iostreams

• dep: libboost-system1.67.0

  knižnica operačného systému (napr. podpora diagnostiky)

• dep: libc6 (>= 2.27)

  knižnica GNU C - zdieľané knižnice
  tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6-udeb

• dep: libgcc1 (>= 1:3.0)

  podporná knižnica GCC

• dep: libgenome0

  toolkit for developing bioinformatic related software

• dep: libmuscle1 (>= 3.7+4565)

  multiple alignment library for protein sequences

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  štandardná knižnica C++ GNU v3

Stiahnuť libmems1

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry

Architektúra	Verzia	Veľkosť balíka	Nainštalovaná veľkosť	Súbory
arm64	1.6.0+4725-8+b1	573.6 kB	1,711.0 kB	[zoznam súborov]