Balík: clustalx (2.1+lgpl-8)

[ Zdroj: clustalx  ]

balík na viacnásobné zarovnávanie sekvencií nukleových kyselín a bielkovín - grafické rozhranie

Tento balík ponúka grafické používateľské rozhranie k programu Clustal Multiple Sequence Alignment (MSA). Poskytuje integrované prostredie na viacnásobné zarovnávanie sekvencií a profilov na analyzovanie výsledkov. Zarovnanie sekvencií sa zobrazuje v okne na obrazovke. Všestranná schéma farieb zvýrazňuje zachované rysy zarovnania. Na profesionálnu prezentáciu by ste mali použiť balíky LaTeXu texshade alebo boxshade.

Roletové menu v hornej časti okna vám umožňujú zvoliť všetky voľby potrebné pre tradičné viacnásobné zarovnávanie sekvencií a profilov . Môžete vkladať sekvencie, aby ste zmenili poradie zarovnania. Môžete vybrať podmnožinu sekvencií, ktoré chcete zarovnať. Môžete vybrať podrozsah zarovnania, ktorý chcete znovu zarovnať a vložiť späť do pôvodného zarovnania.

Môžete vykonať analýzu kvality zarovnania a zvýrazniť úseky s nízkym počtom bodov alebo výnimočné rezíduá.

Značky: Biológia: Clustal/ALN, Proteins, Pole: field::biology, field::biology:bioinformatics, Implementované v: implemented-in::c, interface::commandline, User Interface: Graphical User Interface, interface::x11, role::program, Scope: Utility, Sada nástrojov používateľského rozhrania: Lesstif/Motif, uitoolkit::qt, use::analysing, Purpose: Porovnávanie, use::viewing, works-with-format::plaintext, Works with: Need an extra tag, X Window System: Aplikácia

Ostatné balíky súvisiace s balíkom clustalx

• dep: libc6 (>= 2.14)

  knižnica GNU C - zdieľané knižnice
  tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6-udeb

• dep: libgcc1 (>= 1:3.0)

  podporná knižnica GCC

• dep: libgl1

  knižnica dispečera GL nezávislá od dodávateľa - podpora spätnej kompatibility s GL

• dep: libqt5core5a (>= 5.11.0~rc1)

  základný modul Qt 5

• dep: libqt5gui5 (>= 5.2.0)

  modul grafického používateľského rozhrania Qt 5

• dep: libqt5widgets5 (>= 5.0.2)

  modul ovládacích prvkov Qt 5

• dep: libqt5xml5 (>= 5.0.2)

  Qt 5 - XML modul

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  štandardná knižnica C++ GNU v3

• sug: boxshade

  Pretty-printing of multiple sequence alignments

• sug: clustalw

  globálne viacnásobné zarovnávanie sekvencií nukleotidov alebo peptidov

• sug: texlive-latex-extra

  TeX Live: LaTeX additional packages

Stiahnuť clustalx

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry

Architektúra	Veľkosť balíka	Nainštalovaná veľkosť	Súbory
amd64	435.7 kB	1,374.0 kB	[zoznam súborov]