Balík: metastudent (2.0.1-6)

[ Zdroj: metastudent  ]

predictor of Gene Ontology terms from protein sequence

Often, only the sequence of a protein is known, but not its functions. Metastudent will try to predict missing functional annotations through homology searches (BLAST).

All predicted functions correspond to Gene Ontology (GO) terms from the Molecular Function (MFO), the Biological Process (BPO) and the Cellular Component Ontology (CCO) and are associated with a reliability score.

Ostatné balíky súvisiace s balíkom metastudent

• dep: blast2

  prechodový fiktívny balík na ncbi-blast+-legacy

• dep: default-jre

  štandardné dynamické prostredie Java alebo kompatibilné s Javou

• dep: libfile-chdir-perl

  rozumnejší spôsob zmeny aktuálneho adresára

• dep: libgo-perl (>= 0.15-3)

  perl modules for GO and other OBO ontologies

• dep: libgraphviz-perl

  rozhranie jazyka Perl k nástroju GraphViz na tvorbu grafov

• dep: libipc-run-perl

  modul jazyka Perl na spúšťanie procesov

• dep: metastudent-data (>= 2.0.0)

  predictor of Gene Ontology terms from protein sequence - data files

• dep: perl

  Practical Extraction and Report Language od Larryho Walla

• dep: python

  interaktívny vysokoúrovňový objektovo orientovaný jazyk (verzia python2)

Stiahnuť metastudent

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry

Architektúra	Veľkosť balíka	Nainštalovaná veľkosť	Súbory
all	5,853.9 kB	94,959.0 kB	[zoznam súborov]