Balík: gromacs-mpich (2020.6-2)

[ Zdroj: gromacs  ]

simulátor dynamiky molekúl - spustiteľné súbory na paralelizáciu MPICH

GROMACS je všestranný balík na simuláciu dynamiky molekúl, t.j. Newtonovských pohybových rovníc systémov so stovkami až miliónmi častíc.

Je primárne určený na biochemické molekuly ako sú bielkoviny a tuky, ktoré majú množstvo komplikovaných väzbových interakcií, ale keďže GROMACS dokáže veľmi rýchlo počítať neväzbové interakcie (ktoré v simuláciách väčšinou prevažujú), mnohé výskumné skupiny ho môžu využiť aj pri výskume nebiologických systémov, napr. polymérov.

Tento balík obsahuje iba základné simulačné jadro s podporou paralelizácie pomocou rozhrania MPICH (v3). Je vhodný pre uzly vy výpočtovom klastri alebo na viacprocesorových počítačoch.

Značky: Software Development: Vývoj v C, Knižnice, Pole: Biológia, field::chemistry, implemented-in::c, User Interface: Príkazový riadok, Role: role::devel-lib, role::program, Scope: Utility, Works with: Packaged Software

Ostatné balíky súvisiace s balíkom gromacs-mpich

• dep: libc6 (>= 2.29)

  knižnica GNU C - zdieľané knižnice
  tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6-udeb

• dep: libfftw3-double3 (>= 3.3.5)

  knižnica na výpočet rýchlych fourierovych transformácií - dvojitá presnosť

• dep: libfftw3-single3 (>= 3.3.5)

  knižnica na počítanie rýchlych fourierovych transformácií - jednoduchá presnosť

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0)

  podporná knižnica GCC

• dep: libgomp1 (>= 4.9)

  podporná knižnica GCC OpenMP (GOMP)

• dep: libhwloc15 (>= 2.4.1+dfsg)

  hierarchický pohľad na počítač - zdieľané knižnice

• dep: libmpich12 (>= 3.4.1)

  Shared libraries for MPICH

• dep: libstdc++6 (>= 6)

  štandardná knižnica C++ GNU v3

• dep: mpich

  Implementation of the MPI Message Passing Interface standard

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.0)

  komprimačná knižnica - dynamická verzia

• rec: gromacs

  Molecular dynamics simulator, with building and analysis tools

• sug: gromacs-data

  GROMACS molecular dynamics sim, data and documentation

Stiahnuť gromacs-mpich

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry

Architektúra	Veľkosť balíka	Nainštalovaná veľkosť	Súbory
s390x	3,277.8 kB	13,055.0 kB	[zoznam súborov]