Balík: velvet (1.2.10+dfsg1-7)

Odkazy pre velvet

Zdroje Debian:

Stiahnuť zdrojový balík velvet:

Správcovia:

Externé zdroje:

Domovská stránka [www.ebi.ac.uk]

Podobné balíky:

Nucleic acid sequence assembler for very short reads

Velvet is a de novo genomic assembler specially designed for short read sequencing technologies, such as Solexa or 454, developed by Daniel Zerbino and Ewan Birney at the European Bioinformatics Institute (EMBL-EBI), near Cambridge, in the United Kingdom.

Velvet currently takes in short read sequences, removes errors then produces high quality unique contigs. It then uses paired read information, if available, to retrieve the repeated areas between contigs.

Značky: Pole: Biológia, Bioinformatika, Implementované v: implemented-in::c, interface::commandline, Role: Program, Purpose: Analyzovanie

Ostatné balíky súvisiace s balíkom velvet

závisí

odporúča

navrhuje

vylepšuje

dep: libc6 (>= 2.29)

knižnica GNU C - zdieľané knižnice
tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6-udeb
dep: libgomp1 (>= 4.9)

podporná knižnica GCC OpenMP (GOMP)
dep: zlib1g (>= 1:1.2.0.2)

komprimačná knižnica - dynamická verzia

sug: velvet-example

Example data for the Velvet sequence assembler

Stiahnuť velvet

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry
Architektúra	Veľkosť balíka	Nainštalovaná veľkosť	Súbory
ppc64el	672.3 kB	1,586.0 kB	[zoznam súborov]