Balík: r-bioc-titancna (1.28.0-2)

[ Zdroj: r-bioc-titancna  ]

Subclonal copy number and LOH prediction from whole genome sequencing

Hidden Markov model to segment and predict regions of subclonal copy number alterations (CNA) and loss of heterozygosity (LOH), and estimate cellular prevalence of clonal clusters in tumour whole genome sequencing data.

Ostatné balíky súvisiace s balíkom r-bioc-titancna

• dep: libc6 (>= 2.17)

  knižnica GNU C - zdieľané knižnice
  tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6-udeb

• dep: r-api-4.0

  virtuálny balík poskytovaný balíkom r-base-core

• dep: r-api-bioc-3.12

  virtuálny balík poskytovaný balíkom r-bioc-biocgenerics

• dep: r-base-core (>= 4.0.3-1)

  jadro GNU R na štatistické výpočty a grafický systém

• dep: r-bioc-biocgenerics (>= 0.31.6)

  generic functions for Bioconductor

• dep: r-bioc-genomeinfodb (>= 1.8.7)

  BioConductor utilities for manipulating chromosome identifiers

• dep: r-bioc-genomicranges (>= 1.24.3)

  BioConductor representation and manipulation of genomic intervals

• dep: r-bioc-iranges (>= 2.6.1)

  GNU R low-level containers for storing sets of integer ranges

• dep: r-bioc-variantannotation (>= 1.18.7)

  BioConductor annotation of genetic variants

• dep: r-cran-data.table (>= 1.10.4)

  GNU R - rozšírenie Data.frame

• dep: r-cran-dplyr (>= 0.5.0)

  GNU R grammar of data manipulation

• dep: r-cran-foreach (>= 1.4.3)

  GNU R podpora cyklov foreach

Stiahnuť r-bioc-titancna

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry

Architektúra	Veľkosť balíka	Nainštalovaná veľkosť	Súbory
ppc64el	3,858.7 kB	7,663.0 kB	[zoznam súborov]