Balík: cnvkit (0.9.8-1)

[ Zdroj: cnvkit  ]

Copy number variant detection from targeted DNA sequencing

A command-line toolkit and Python library for detecting copy number variants and alterations genome-wide from targeted DNA sequencing. It is designed for use with hybrid capture, including both whole-exome and custom target panels, and short-read sequencing platforms such as Illumina and Ion Torrent.

Ostatné balíky súvisiace s balíkom cnvkit

• dep: python3

  interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

• dep: python3-biopython

  Python3 library for bioinformatics

• dep: python3-matplotlib

  systém v Pythone na vykresľovanie v štýle podobnom Matlabu - Python 3

• dep: python3-numpy

  schopnosti rýchlych polí do jazyka Python 3

• dep: python3-pandas

  údajové štruktúry „relačných“ dát alebo dát „s označením“

• dep: python3-pomegranate

  Fast, flexible and easy to use probabilistic modelling

• dep: python3-pyfaidx

  efficient random access to fasta subsequences for Python 3

• dep: python3-pysam

  interface for the SAM/BAM sequence alignment and mapping format (Python 3)

• dep: python3-reportlab

  knižnica ReportLab na tvorbu dokumentov PDF pomocou Pythonu

• dep: python3-scipy

  vedecké nástroje pre Python 3

• dep: python3-sklearn

  Python modules for machine learning and data mining - Python 3

• dep: r-bioc-dnacopy

  R package: DNA copy number data analysis

Stiahnuť cnvkit

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry

Architektúra	Veľkosť balíka	Nainštalovaná veľkosť	Súbory
ppc64el	15,065.2 kB	69,059.0 kB	[zoznam súborov]