Balík: igdiscover (0.11-3)

[ Zdroj: igdiscover  ]

analyzes antibody repertoires to find new V genes

IgDiscover analyzes antibody repertoires and discovers new V genes from high-throughput sequencing reads. Heavy chains, kappa and lambda light chains are supported (to discover VH, VK and VL genes).

Ostatné balíky súvisiace s balíkom igdiscover

• dep: python3

  interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

• dep: python3-cutadapt

  Clean biological sequences from high-throughput sequencing reads (Python 3)

• dep: python3-matplotlib (>= 1.5.0)

  systém v Pythone na vykresľovanie v štýle podobnom Matlabu - Python 3

• dep: python3-numpy

  schopnosti rýchlych polí do jazyka Python 3

• dep: python3-pandas (>= 0.16.2)

  údajové štruktúry „relačných“ dát alebo dát „s označením“

• dep: python3-ruamel.yaml

  spracovanie YAML - modul jazyka Python 3

• dep: python3-scipy (>= 0.16.1)

  vedecké nástroje pre Python 3

• dep: python3-seaborn (>= 0.9)

  statistical visualization library for Python3

• dep: python3-sqt

  SeQuencing Tools for biological DNA/RNA high-throughput data

• dep: python3-xopen (>= 0.3.2)

  Python3 module to open compressed files transparently

• sug: igdiscover-doc

  analyzes antibody repertoires to find new V genes - doc

• sug: snakemake

  pythonic workflow management system

Stiahnuť igdiscover

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry

Architektúra	Veľkosť balíka	Nainštalovaná veľkosť	Súbory
all	35.5 kB	46.0 kB	[zoznam súborov]