Balík: python3-cyvcf2 (0.30.4-4)

[ Zdroj: cyvcf2  ]

VCF parser based on htslib (Python 3)

This modules allows fast parsing of VCF and BCF including region-queries with Python. This is essential for efficient analyses of nucleotide variation with Python on high-throughput sequencing data.

cyvcf2 is a cython wrapper around htslib. Attributes like variant.gt_ref_depths return a numpy array directly so they are immediately ready for downstream use.

This package installs the library for Python 3.

Ostatné balíky súvisiace s balíkom python3-cyvcf2

• dep: libc6 (>= 2.7)

  knižnica GNU C - zdieľané knižnice
  tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6-udeb

• dep: libhts3 (>= 1.10)

  C library for high-throughput sequencing data formats

• dep: python3

  interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

  dep: python3 (<< 3.10)

  dep: python3 (>= 3.9~)

• dep: python3-click

  wrapper optparse na tvorbu mocných nástrojov príkazového riadka - Python 3.x

• dep: python3-coloredlogs

  colored terminal output for Python 3's logging module

• dep: python3-numpy (>= 1:1.16.0~rc1)

  schopnosti rýchlych polí do jazyka Python 3

• dep: python3-numpy-abi9

  virtuálny balík poskytovaný balíkom python3-numpy

Stiahnuť python3-cyvcf2

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry

Architektúra	Veľkosť balíka	Nainštalovaná veľkosť	Súbory
mipsel	743.9 kB	4,724.0 kB	[zoznam súborov]