Balík: hts-nim-tools (0.2.1-1)

[ Zdroj: hts-nim-tools  ]

tools biological sequences: bam-filter, count-reads, vcf-check

This package provides several tools that (at least at the time of their creation) provide functionalities beyond the routine provided by samtools and other reverse dependencies of the htslib.

These new tools are

 • bam-filter : filter BAM/CRAM/SAM files with a simple expression language
 • count-reads: count BAM/CRAM reads in regions given in a BED file
 • vcf-check  : check regions of a VCF against a background for missing chunks

and yes, as the name suggests, these tools are all implemented in nim, using the nim-hts (upstream: hts-nim) wrapper for the htslib.

Ostatné balíky súvisiace s balíkom hts-nim-tools

• dep: libc6 (>= 2.29)

  knižnica GNU C - zdieľané knižnice
  tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6-udeb

• dep: nim-hts-dev

  wrapper for hts C library

Stiahnuť hts-nim-tools

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry

Architektúra	Veľkosť balíka	Nainštalovaná veľkosť	Súbory
amd64	198.0 kB	864.0 kB	[zoznam súborov]
arm64	164.6 kB	844.0 kB	[zoznam súborov]
armel	182.9 kB	832.0 kB	[zoznam súborov]
armhf	182.9 kB	604.0 kB	[zoznam súborov]
i386	186.0 kB	843.0 kB	[zoznam súborov]
mips64el	137.8 kB	951.0 kB	[zoznam súborov]
mipsel	141.6 kB	934.0 kB	[zoznam súborov]
ppc64el	158.6 kB	916.0 kB	[zoznam súborov]