Balík: beagle (5.1-200518+dfsg-1)

[ Zdroj: beagle  ]

Genotype calling, genotype phasing and imputation of ungenotyped markers

Beagle performs genotype calling, genotype phasing, imputation of ungenotyped markers, and identity-by-descent segment detection. Genotypic imputation works on phased haplotypes using a Li and Stephens haplotype frequency model. Beagle also implements the Refined IBD algorithm for detecting homozygosity-by-descent (HBD) and identity-by-descent (IBD) segments.

Značky: Pole: Biológia, Bioinformatika, Implementované v: implemented-in::java, interface::commandline, Role: Program, Purpose: Analyzovanie

Ostatné balíky súvisiace s balíkom beagle

• dep: default-jre

  štandardné dynamické prostredie Java alebo kompatibilné s Javou

  alebo java11-runtime

  virtuálny balík poskytovaný balíkom default-jre, openjdk-11-jre, openjdk-17-jre

• dep: libhtsjdk-java

  Java API for high-throughput sequencing data (HTS) formats

• sug: beagle-doc

  Documentation for Beagle

Stiahnuť beagle

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry

Architektúra	Veľkosť balíka	Nainštalovaná veľkosť	Súbory
all	298.5 kB	622.0 kB	[zoznam súborov]