Balík: r-cran-sctransform (0.3.5-1)

[ Zdroj: r-cran-sctransform  ]

Variance Stabilizing Transformations for Single Cell UMI Data

A normalization method for single-cell UMI count data using a variance stabilizing transformation. The transformation is based on a negative binomial regression model with regularized parameters. As part of the same regression framework, this package also provides functions for batch correction, and data correction. See Hafemeister and Satija 2019 <doi:10.1101/576827> for more details.

Ostatné balíky súvisiace s balíkom r-cran-sctransform

• dep: libblas3

  referenčné implementácie základnej lineárnej algebry - zdieľaná knižnica

  alebo libblas.so.3

  virtuálny balík poskytovaný balíkom libatlas3-base, libblas3, libblis4-openmp, libblis4-pthread, libblis4-serial, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial

• dep: libc6 (>= 2.29)

  knižnica GNU C - zdieľané knižnice
  tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [nie armel, armhf, ppc64el]

  podporná knižnica GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4.4) [ppc64el]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: liblapack3

  knižnica rutín lineárnej algebry, verzia 3 - zdieľaná knižnica

  alebo liblapack.so.3

  virtuálny balík poskytovaný balíkom libatlas3-base, liblapack3, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial

• dep: libstdc++6 (>= 5.2) [armel, armhf]

  štandardná knižnica C++ GNU v3

  dep: libstdc++6 (>= 9) [nie armel, armhf]

• dep: r-api-4.0

  virtuálny balík poskytovaný balíkom r-base-core

• dep: r-base-core (>= 4.2.1-2)

  jadro GNU R na štatistické výpočty a grafický systém

• dep: r-cran-dplyr

  GNU R grammar of data manipulation

• dep: r-cran-future

  R package: A Future API for R

• dep: r-cran-future.apply

  apply function to elements in parallel using futures

• dep: r-cran-ggplot2

  implementácia Gramatiky grafiky

• dep: r-cran-gridextra

  GNU R - balík s rozšíreniami balíka grid

• dep: r-cran-magrittr

  GNU R - operátor dopredná rúra

• dep: r-cran-mass

  balík MASS pre GNU R od Venable a Ripley

• dep: r-cran-matrix (>= 1.5-0)

  balík tried GNU R pre husté a riedke matice

• dep: r-cran-matrixstats

  GNU R methods that apply to rows and columns of a matrix

• dep: r-cran-rcpp (>= 0.11.0)

  balík GNU R na hladkú integráciu R a C++

• dep: r-cran-rcpparmadillo

  GNU R package for Armadillo C++ linear algebra library

• dep: r-cran-reshape2

  flexibilná zmena tvaru dát - reboot balíka reshape

• dep: r-cran-rlang

  Functions for Base Types and Core R and 'Tidyverse' Features

• rec: r-cran-testthat

  GNU R testsuite

• sug: r-cran-irlba

  GNU R fast truncated SVD, PCA and symmetric eigendecomposition

• sug: r-cran-knitr

  balík GNU R na dynamickú tvorbu zostáv pomocou Literate Programming

Stiahnuť r-cran-sctransform

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry

Architektúra	Veľkosť balíka	Nainštalovaná veľkosť	Súbory
amd64	479.0 kB	726.0 kB	[zoznam súborov]
arm64	467.4 kB	758.0 kB	[zoznam súborov]
armel	469.9 kB	756.0 kB	[zoznam súborov]
armhf	469.1 kB	692.0 kB	[zoznam súborov]
i386	483.2 kB	732.0 kB	[zoznam súborov]
mips64el	465.7 kB	769.0 kB	[zoznam súborov]
mipsel	468.0 kB	763.0 kB	[zoznam súborov]
ppc64el	476.4 kB	823.0 kB	[zoznam súborov]
s390x	471.4 kB	730.0 kB	[zoznam súborov]