Balík: murasaki-common (1.68.6-13)

[ Zdroj: murasaki  ]

homology detection tool across multiple large genomes (common files)

Murasaki is a scalable and fast, language theory-based homology detection tool across multiple large genomes. It enable whole-genome scale multiple genome global alignments. Supports unlimited length gapped-seed patterns and unique TF-IDF based filtering.

Murasaki is an anchor alignment software, which is

 * exteremely fast (17 CPU hours for whole Human x Mouse genome (with
   40 nodes: 52 wall minutes))
 * scalable (Arbitrarily parallelizable across multiple nodes using MPI.
   Even a single node with 16GB of ram can handle over 1Gbp of sequence.)
 * unlimited pattern length
 * repeat tolerant
 * intelligent noise reduction

This package contains all files that are common to the single core murasaki package and the multi core murasaki-mpi package.

Ostatné balíky súvisiace s balíkom murasaki-common

• dep: gnuplot

  program na interaktívne kreslenie riadený z príkazového riadka
  tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom gnuplot-nox, gnuplot-qt, gnuplot-x11

  alebo gnuplot5

  Balík nie je dostupný

• dep: imagemagick

  programy na manipuláciu s obrázkami - binárne súbory
  tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom graphicsmagick-imagemagick-compat, imagemagick-6.q16

• dep: libbio-perl-perl

  BioPerl - základné moduly jazyka Perl

• dep: r-cran-rocr

  GNU R package to prepare and display ROC curves

• rec: libterm-readkey-perl

  modul jazyka Perl na jednoduché ovládanie terminálu

• rec: libtext-wrapi18n-perl

  internationalized substitute of Text::Wrap

  alebo libtext-wrapper-perl

  jednoduchá funkcia na zalamovanie slov

Stiahnuť murasaki-common

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry

Architektúra	Veľkosť balíka	Nainštalovaná veľkosť	Súbory
all	141.9 kB	433.0 kB	[zoznam súborov]