Balík: meryl (0~20150903+r2013-8 a iné)

[ Zdroj: kmer  ]

in- and out-of-core kmer counting and utilities

meryl computes the kmer content of genomic sequences. Kmer content is represented as a list of kmers and the number of times each occurs in the input sequences. The kmer can be restricted to only the forward kmer, only the reverse kmer, or the canonical kmer (lexicographically smaller of the forward and reverse kmer at each location). Meryl can report the histogram of counts, the list of kmers and their counts, or can perform mathematical and set operations on the processed data files.

This package is part of the Kmer suite.

Ostatné balíky súvisiace s balíkom meryl

• dep: libc6 (>= 2.34)

  knižnica GNU C - zdieľané knižnice
  tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 4.2)

  podporná knižnica GCC

• dep: libstdc++6 (>= 5)

  štandardná knižnica C++ GNU v3

• sug: gridengine-client

  nástroje na správu frontov Grid Engine

Stiahnuť meryl

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry

Architektúra	Verzia	Veľkosť balíka	Nainštalovaná veľkosť	Súbory
mipsel	0~20150903+r2013-8+b3	261.4 kB	2,125.0 kB	[zoznam súborov]