Balík: r-bioc-nanostringqcpro (1.30.0-1)

[ Zdroj: r-bioc-nanostringqcpro  ]

processing and QA for NanoString mRNA expression data

NanoStringQCPro provides a set of quality metrics that can be used to assess the quality of NanoString mRNA gene expression data -- i.e. to identify outlier probes and outlier samples. It also provides different background subtraction and normalization approaches for this data. It outputs suggestions for flagging samples/probes and an easily sharable html quality control output.

Ostatné balíky súvisiace s balíkom r-bioc-nanostringqcpro

• dep: r-api-4.0

  virtuálny balík poskytovaný balíkom r-base-core

• dep: r-api-bioc-3.16

  virtuálny balík poskytovaný balíkom r-bioc-biocgenerics

• dep: r-base-core (>= 4.2.2.20221110-1)

  jadro GNU R na štatistické výpočty a grafický systém

• dep: r-bioc-annotationdbi (>= 1.26.0)

  GNU R Annotation Database Interface for BioConductor

• dep: r-bioc-biobase (>= 2.24.0)

  base functions for Bioconductor

• dep: r-bioc-org.hs.eg.db (>= 2.14.0)

  genome-wide annotation for Human

• dep: r-cran-knitr (>= 1.12)

  balík GNU R na dynamickú tvorbu zostáv pomocou Literate Programming

• dep: r-cran-nmf (>= 0.20.5)

  GNU R framework to perform non-negative matrix factorization

• dep: r-cran-png (>= 0.1-7)

  balík GNU R na čítanie a zápis obrázkov PNG

• dep: r-cran-rcolorbrewer (>= 1.0-5)

  balík GNU R poskytujúci vhodné palety farieb

• sug: r-bioc-biocstyle

  standard styles for vignettes and other Bioconductor documents

• sug: r-cran-rmarkdown

  convert R markdown documents into a variety of formats

• sug: r-cran-roxygen2 (>= 4.0.1)

  in-line documentation for GNU R

• sug: r-cran-testthat

  GNU R testsuite

Stiahnuť r-bioc-nanostringqcpro

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry

Architektúra	Veľkosť balíka	Nainštalovaná veľkosť	Súbory
all	453.0 kB	708.0 kB	[zoznam súborov]