Balík: macsyfinder (2.0-2 a iné)

[ Zdroj: macsyfinder  ]

detection of macromolecular systems in protein datasets

MacSyFinder is a program to model and detect macromolecular systems, genetic pathways... in protein datasets. In prokaryotes, these systems have often evolutionarily conserved properties: they are made of conserved components, and are encoded in compact loci (conserved genetic architecture). The user models these systems with MacSyFinder to reflect these conserved features, and to allow their efficient detection

This package presents the Open Source Java API to biological databases and a series of mostly sequence-based algorithms.

Ostatné balíky súvisiace s balíkom macsyfinder

• dep: hmmer

  profile hidden Markov models for protein sequence analysis

• dep: libjs-jquery

  JavaScript library for dynamic web applications

• dep: libjs-sphinxdoc (>= 5.2)

  podpora JavaScriptu v dokumentácii Sphinx

• dep: libjs-underscore

  pomocná knižnica JavaScriptu na funkcionálne programovanie

• dep: ncbi-blast+

  next generation suite of BLAST sequence search tools

• dep: python3

  interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

• dep: python3-certifi

  koreňové certifikáty na overovanie certifikátov SSL a hostiteľov TLS - Python 3

• dep: python3-colorama

  multiplatformný modul farebného textu pre Python 3.x

• dep: python3-colorlog

  formatter to use with the logging module of Python 3

• dep: python3-networkx

  nástroj na tvorbu, manipuláciu a študovanie komplexných sietí - Python 3

• dep: python3-packaging

  základné nástroje balíkov jazyka Python 3

• dep: python3-pandas

  údajové štruktúry „relačných“ dát alebo dát „s označením“

• dep: python3-yaml

  spracovanie a tvorbu YAML v jazyku Python 3

• dep: sphinx-rtd-theme-common (>= 1.2.0+dfsg)

  téma vzhľadu pre sphinx z readthedocs.org - spoločné súbory

Stiahnuť macsyfinder

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry

Architektúra	Verzia	Veľkosť balíka	Nainštalovaná veľkosť	Súbory
amd64	2.0-2+b1	11,809.2 kB	31,261.0 kB	[zoznam súborov]