Пакет: tree-puzzle (5.3~rc16+dfsg-10)

[ Источник: tree-puzzle  ]

Reconstruction of phylogenetic trees by maximum likelihood

TREE-PUZZLE (the new name for PUZZLE) is an interactive console program that implements a fast tree search algorithm, quartet puzzling, that allows analysis of large data sets and automatically assigns estimations of support to each internal branch. TREE-PUZZLE also computes pairwise maximum likelihood distances as well as branch lengths for user specified trees. Branch lengths can also be calculated under the clock-assumption. In addition, TREE-PUZZLE offers a novel method, likelihood mapping, to investigate the support of a hypothesized internal branch without computing an overall tree and to visualize the phylogenetic content of a sequence alignment.

Теги: Область: Биология, Биоинформатика, Реализовано на: implemented-in::c, interface::commandline, Роль: Программа, Область: Утилита, Цель: use::analysing, use::comparing, Поддерживаемые форматы: Простой текст, Работает с: Требуется дополнительный тег

Другие пакеты, относящиеся к tree-puzzle

• dep: libc6 (>= 2.34)

  библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb

• dep: libsprng2

  SPRNG Scalable Parallel RNG library -- library package

• rec: tree-puzzle-doc

  Reconstruction of phylogenetic trees by maximum likelihood (doc)

• sug: phylip

  package of programs for inferring phylogenies

• sug: treetool

  Пакет недоступен

Загрузка tree-puzzle

Загрузить для всех доступных архитектур

Архитектура	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
amd64	165,9 Кб	400,0 Кб	[список файлов]
arm64	151,9 Кб	428,0 Кб	[список файлов]
armel	161,1 Кб	411,0 Кб	[список файлов]
armhf	151,6 Кб	303,0 Кб	[список файлов]
i386	179,0 Кб	491,0 Кб	[список файлов]
mips64el	165,1 Кб	507,0 Кб	[список файлов]
ppc64el	175,6 Кб	492,0 Кб	[список файлов]
riscv64	168,6 Кб	348,0 Кб	[список файлов]
s390x	176,7 Кб	439,0 Кб	[список файлов]