Пакет: sumaclust (1.0.36+ds-2)

[ Источник: sumaclust  ]

fast and exact clustering of genomic sequences

With the development of next-generation sequencing, efficient tools are needed to handle millions of sequences in reasonable amounts of time. Sumaclust is a program developed by the LECA. Sumaclust aims to cluster sequences in a way that is fast and exact at the same time. This tool has been developed to be adapted to the type of data generated by DNA metabarcoding, i.e. entirely sequenced, short markers. Sumaclust clusters sequences using the same clustering algorithm as UCLUST and CD- HIT. This algorithm is mainly useful to detect the 'erroneous' sequences created during amplification and sequencing protocols, deriving from 'true' sequences.

Другие пакеты, относящиеся к sumaclust

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

  dep: libc6 (>= 2.7) [не amd64, arm64, ppc64el]

• dep: libgomp1 (>= 6)

  вспомогательная библиотека GCC OpenMP (GOMP)

• dep: libsuma1 (>= 1.0.35)

  shared library for sumatra and sumaclust

Загрузка sumaclust

Загрузить для всех доступных архитектур

Архитектура	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
amd64	100,6 Кб	164,0 Кб	[список файлов]
arm64	99,6 Кб	195,0 Кб	[список файлов]
armel	101,6 Кб	195,0 Кб	[список файлов]
armhf	99,5 Кб	195,0 Кб	[список файлов]
i386	100,9 Кб	163,0 Кб	[список файлов]
mips64el	100,1 Кб	197,0 Кб	[список файлов]
ppc64el	101,4 Кб	260,0 Кб	[список файлов]
s390x	99,5 Кб	159,0 Кб	[список файлов]