Пакет: nanolyse (1.2.0-4 и другие)

[ Источник: nanolyse  ]

remove lambda phage reads from a fastq file

NanoLyse is a tool for rapid removal of contaminant DNA, using the Minimap2 aligner through the mappy Python binding. A typical application would be the removal of the lambda phage control DNA fragment supplied by ONT, for which the reference sequence is included in the package. However, this approach may lead to unwanted loss of reads from regions highly homologous to the lambda phage genome.

Другие пакеты, относящиеся к nanolyse

• dep: python3

  интерактивный высокоуровневый объектно-ориентированный язык (версия python3 по умолчанию)

• dep: python3-biopython

  Python3 library for bioinformatics

• dep: python3-mappy

  Python3 interface minimap2

Загрузка nanolyse

Загрузить для всех доступных архитектур

Архитектура	Версия	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
amd64	1.2.0-4	24,7 Кб	66,0 Кб	[список файлов]
arm64	1.2.0-4	24,7 Кб	66,0 Кб	[список файлов]
armel	1.2.0-4	24,7 Кб	66,0 Кб	[список файлов]
armhf	1.2.0-4	24,7 Кб	66,0 Кб	[список файлов]
i386	1.2.0-4	24,7 Кб	66,0 Кб	[список файлов]
mips64el	1.2.0-4	24,7 Кб	66,0 Кб	[список файлов]
ppc64el	1.2.0-4	24,7 Кб	66,0 Кб	[список файлов]
riscv64	1.2.0-4+b1	25,0 Кб	67,0 Кб	[список файлов]
s390x	1.2.0-4	24,7 Кб	66,0 Кб	[список файлов]