Пакет: insilicoseq (2.0.1-1)

[ Источник: insilicoseq  ]

sequencing simulator producing realistic Illumina reads

Primarily intended for simulating metagenomic samples, it can also be used to produce sequencing data from a single genome.

InSilicoSeq is written in Python, and use kernel density estimators to model the read quality of real sequencing data.

InSilicoSeq support substitution, insertion and deletion errors. If you don't have the use for insertion and deletion error a basic error model is provided.

Другие пакеты, относящиеся к insilicoseq

• dep: python3

  интерактивный высокоуровневый объектно-ориентированный язык (версия python3 по умолчанию)

• dep: python3-biopython

  Python3 library for bioinformatics

• dep: python3-numpy

  Fast array facility to the Python language (Python 3)

• dep: python3-pysam

  interface for the SAM/BAM sequence alignment and mapping format (Python 3)

• dep: python3-requests

  elegant and simple HTTP library for Python3, built for human beings

• dep: python3-scipy

  scientific tools for Python 3

Загрузка insilicoseq

Загрузить для всех доступных архитектур

Архитектура	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
all	4 135,0 Кб	9 076,0 Кб	[список файлов]