Пакет: ltrsift (1.0.2-10)

[ Источник: ltrsift  ]

postprocessing and classification of LTR retrotransposons

LTRsift is a graphical desktop tool for semi-automatic postprocessing of de novo predicted LTR retrotransposon annotations, such as the ones generated by LTRharvest and LTRdigest. Its user-friendly interface displays LTR retrotransposon candidates, their putative families and their internal structure in a hierarchical fashion, allowing the user to "sift" through the sometimes large results of de novo prediction software. It also offers customizable filtering and classification functionality.

Теги: Область: Биология, Биоинформатика, Реализовано на: implemented-in::c, interface::commandline, Пользовательский интерфейс: Graphical User Interface, interface::x11, role::program, Область: Утилита, Инструментарий интерфейса: GTK, Цель: use::analysing, use::browsing, Сравнение, Организация данных, use::viewing, x11::application

Другие пакеты, относящиеся к ltrsift

• dep: libc6 (>= 2.34)

  библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb

• dep: libcairo2 (>= 1.2.4)

  библиотека для двухмерной векторной графики Cairo

• dep: libgdk-pixbuf-2.0-0 (>= 2.22.0)

  библиотека GDK Pixbuf

• dep: libgenometools0t64 (>= 1.6.5+ds)

  versatile genome analysis library

• dep: libglib2.0-0t64 (>= 2.75.3)

  библиотека С-функций

• dep: libgtk2.0-0t64 (>= 2.18.0)

  GTK graphical user interface library - old version

• dep: libpango-1.0-0 (>= 1.14.0)

  библиотека компоновки и отрисовки текста на разных языках

• rec: last-align

  genome-scale comparison of biological sequences

• rec: ncbi-blast+

  поиск первичных биологических последовательностей

Загрузка ltrsift

Загрузить для всех доступных архитектур

Архитектура	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
i386	106,3 Кб	410,0 Кб	[список файлов]