Пакет: bwa (0.7.18-1)
Ссылки для bwa
Ресурсы Debian:
- Сообщения об ошибках
- Developer Information
- Debian журнал изменений
- Файл авторских прав
- Отслеживание заплат Debian
Исходный код bwa:
Сопровождающие:
- Debian Med Packaging Team (Страница КК, Почтовый архив)
- Charles Plessy (Страница КК)
- Andreas Tille (Страница КК)
- Carlos Borroto (Страница КК)
- Ognyan Kulev (Страница КК)
- Michael R. Crusoe (Страница КК)
Внешние ресурсы:
- Сайт [bio-bwa.sourceforge.net]
Подобные пакеты:
Burrows-Wheeler Aligner
BWA is a software package for mapping low-divergent sequences against a large reference genome, such as the human genome. It consists of three algorithms: BWA-backtrack, BWA-SW and BWA-MEM. The first algorithm is designed for Illumina sequence reads up to 100bp, while the rest two for longer sequences ranged from 70bp to 1Mbp. BWA-MEM and BWA-SW share similar features such as long-read support and split alignment, but BWA-MEM, which is the latest, is generally recommended for high-quality queries as it is faster and more accurate. BWA-MEM also has better performance than BWA-backtrack for 70-100bp Illumina reads.
Другие пакеты, относящиеся к bwa
|
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.34)
- библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb
-
- dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
- библиотека сжатия
-
- rec: perl
- практический язык Ларри Уолла для извлечения данных и составления отчётов
-
- sug: samtools
- processing sequence alignments in SAM, BAM and CRAM formats
Загрузка bwa
Архитектура | Размер пакета | В установленном виде | Файлы |
---|---|---|---|
i386 | 231,1 Кб | 522,0 Кб | [список файлов] |