Пакет: adapterremoval (2.3.3-3)

[ Источник: adapterremoval  ]

rapid adapter trimming, identification, and read merging of gene sequences

This program searches for and removes remnant adapter sequences from High- Throughput Sequencing (HTS) data and (optionally) trims low quality bases from the 3' end of reads following adapter removal. AdapterRemoval can analyze both single end and paired end data, and can be used to merge overlapping paired-ended reads into (longer) consensus sequences. Additionally, the AdapterRemoval may be used to recover a consensus adapter sequence for paired-ended data, for which this information is not available.

Другие пакеты, относящиеся к adapterremoval

• dep: libbz2-1.0

  библиотека сжатия по алгоритму Барроуза—Уилера (динамическая версия)

• dep: libc6 (>= 2.34)

  библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.5)

  вспомогательная библиотека GCC

• dep: libstdc++6 (>= 13.1)

  стандартная библиотека GNU C++ версии 3

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  библиотека сжатия

Загрузка adapterremoval

Загрузить для всех доступных архитектур

Архитектура	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
armel	157,3 Кб	473,0 Кб	[список файлов]