Пакет: python3-unifrac (1.3-4)

[ Источник: unifrac  ]

high-performance phylogenetic diversity calculations

The de facto repository for high-performance phylogenetic diversity calculations. The methods in this repository are based on an implementation of the Strided State UniFrac algorithm which is faster, and uses less memory than Fast UniFrac. Strided State UniFrac supports Unweighted UniFrac, Weighted UniFrac, Generalized UniFrac, Variance Adjusted UniFrac and meta UniFrac. This repository also includes Stacked Faith (manuscript in preparation), a method for calculating Faith's PD that is faster and uses less memory than the Fast UniFrac-based reference implementation.

This package contains the Python3 module.

Другие пакеты, относящиеся к python3-unifrac

• dep: libc6 (>= 2.17)

  библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb

• dep: libssu0 (>= 1.4)

  high-performance phylogenetic diversity calculations (lib)

• dep: python3

  интерактивный высокоуровневый объектно-ориентированный язык (версия python3 по умолчанию)

  dep: python3 (<< 3.13)

  dep: python3 (>= 3.12~)

• dep: python3-biom-format

  Biological Observation Matrix (BIOM) format (Python 3)

• dep: python3-h5py (>= 3.3.0)

  general-purpose Python interface to hdf5

• dep: python3-iow

  balanced parentheses tree structure

• dep: python3-numpy (>= 1:1.25.0)

  Fast array facility to the Python language (Python 3)

• dep: python3-numpy-abi9

  виртуальный пакет, предоставляемый python3-numpy

• dep: python3-skbio (>= 0.6.1)

  Python3 data structures, algorithms, educational resources for bioinformatic

Загрузка python3-unifrac

Загрузить для всех доступных архитектур

Архитектура	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
arm64	129,8 Кб	684,0 Кб	[список файлов]