Пакет исходного кода: cnvkit (0.9.10-3~0exp0)
Ссылки для cnvkit
Ресурсы Debian:
- Сообщения об ошибках
- Developer Information
- Debian журнал изменений
- Файл авторских прав
- Репозиторий исходного кода Debian (Git)
- Отслеживание заплат Debian
Сопровождающие:
- Debian Med Packaging Team (Страница КК, Почтовый архив)
- Michael R. Crusoe (Страница КК)
- Steffen Moeller (Страница КК)
- Olivier Sallou (Страница КК)
Внешние ресурсы:
- Сайт [cnvkit.readthedocs.org]
Экспериментальный пакет
Предупреждение: данный пакет находится в экспериментальной ветке дистрибутива. Это означает, что он нестабилен или содержит ошибки, и даже может вызвать потерю данных. Перед использованием внимательно прочитайте файл changelog и другую доступную документацию.
Из этого пакета исходного кода собираются следующие двоичные пакеты:
- cnvkit
- Copy number variant detection from targeted DNA sequencing
Другие пакеты, относящиеся к cnvkit
|
|
-
- adep: debhelper-compat (= 13)
- Пакет недоступен
-
- adep: dh-sequence-python3
- Пакет недоступен
-
- adep: python3-all
- package depending on all supported Python 3 runtime versions
-
- adep: python3-setuptools
- Python3 Distutils Enhancements
-
- adep: pybuild-plugin-pyproject
- Debian helper tools for packaging Python libraries using PEP517
-
- adep: python3-pytest
- Simple, powerful testing in Python3
-
- adep: python3-pyfaidx
- efficient random access to fasta subsequences for Python 3
-
- adep: python3-biopython
- Python3 library for bioinformatics
-
- adep: python3-pandas
- data structures for "relational" or "labeled" data
-
- adep: python3-numpy
- Python library for numerical computations (Python 3)
-
- adep: python3-pysam
- interface for the SAM/BAM sequence alignment and mapping format (Python 3)
-
- adep: python3-scipy
- scientific tools for Python 3
-
- adep: python3-matplotlib
- Python based plotting system in a style similar to Matlab
-
- adep: python3-pomegranate
- Fast, flexible and easy to use probabilistic modelling
-
- adep: r-bioc-dnacopy (>= 1.78.0)
- R package: DNA copy number data analysis
-
- adep: poppler-utils
- инструменты для работы с документами PDF, основанные на Poppler
Download cnvkit
| Файл | Размер (в Кб) | Контрольная сумма MD5 |
|---|---|---|
| cnvkit_0.9.10-3~0exp0.dsc | 2,4 Кб | a972ab0601e5875fef47fac07f33125e |
| cnvkit_0.9.10.orig.tar.gz | 23 108,4 Кб | ac1e8d636fc0fc694d1475a212d0cf98 |
| cnvkit_0.9.10-3~0exp0.debian.tar.xz | 17,3 Кб | d6423a6acc31aea516cf9f337be69c58 |
- Репозиторий пакетов исходного кода Debian (VCS: Git)
- https://salsa.debian.org/med-team/cnvkit.git
- Репозиторий пакетов исходного кода Debian (доступен просмотр)
- https://salsa.debian.org/med-team/cnvkit