Пакет исходного кода: python-cogent (1.9-14)
Ссылки для python-cogent
Ресурсы Debian:
Сопровождающие:
Внешние ресурсы:
Из этого пакета исходного кода собираются следующие двоичные пакеты:
- python-cogent
- framework for genomic biology
- python-cogent-doc
- docs for python-cogent
Другие пакеты, относящиеся к python-cogent
-
- adep:
debhelper
(>= 11~)
- вспомогательные программы для debian/rules
-
- adep:
dh-python
- вспомогательные инструменты для создания Debian-пакетов для библиотек и приложений на Python
-
- adep:
python-all-dev
- package depending on all supported Python2 development packages
-
- adep:
python-matplotlib
- Python based plotting system in a style similar to Matlab
-
- adep:
python-numpy
- быстрые методы работы с числовыми массивами – модуль для языка Python
-
- adep:
python-setuptools
- дополнения к Python Distutils
-
- adep:
python3-sphinx
- documentation generator for Python projects (implemented in Python 3)
-
- adep:
cython
- C-Extensions for Python
-
- adep:
blast2
- пустой переходный пакет для ncbi-blash+-legacy
-
- adep:
bwa
[any-amd64]
- Burrows-Wheeler Aligner
-
- adep:
cd-hit
- suite of programs designed to quickly group sequences
-
- adep:
cdbfasta
- Constant DataBase indexing and retrieval tools for multi-FASTA files
-
- adep:
clearcut
- extremely efficient phylogenetic tree reconstruction
-
- adep:
clustalw
- global multiple nucleotide or peptide sequence alignment
-
- adep:
dialign
- Segment-based multiple sequence alignment
-
- adep:
fasttree
- phylogenetic trees from alignments of nucleotide or protein sequences
-
- adep:
infernal
[any-amd64 any-i386]
- inference of RNA secondary structural alignments
-
- adep:
mafft
- Multiple alignment program for amino acid or nucleotide sequences
-
- adep:
mothur
[не s390x]
- sequence analysis suite for research on microbiota
-
- adep:
muscle
- Multiple alignment program of protein sequences
-
- adep:
parsinsert
- Parsimonious Insertion of unclassified sequences into phylogenetic trees
-
- adep:
raxml
[any-amd64 any-i386]
- синтез филогенетических деревьев по методу максимального правдоподобия
-
- adep:
rdp-classifier
- extensible sequence classifier for fungal lsu, bacterial and archaeal 16s
-
- adep:
rtax
- Classification of sequence reads of 16S ribosomal RNA gene