Пакет: python3-pairtools (0.3.0-3.2 и другие) [debports]

[ Источник:  ]

Framework to process sequencing data from a Hi-C experiment

Simple and fast command-line framework to process sequencing data from a Hi-C experiment.

Process pair-end sequence alignments and perform the following operations:

  - Detect ligation junctions (a.k.a. Hi-C pairs) in aligned paired-end
    sequences of Hi-C DNA molecules
  - Sort .pairs files for downstream analyses
  - Detect, tag and remove PCR/optical duplicates
  - Generate extensive statistics of Hi-C datasets
  - Select Hi-C pairs given flexibly defined criteria
  - Restore .sam alignments from Hi-C pairs

Другие пакеты, относящиеся к python3-pairtools

• dep: cython3

  C-Extensions for Python 3

• dep: libc6 (>= 2.16)

  библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb

• dep: python3

  интерактивный высокоуровневый объектно-ориентированный язык (версия python3 по умолчанию)

  dep: python3 (<< 3.11)

  dep: python3 (>= 3.10~)

• dep: python3-click

  Command-Line Interface Creation Kit - Python 3.x

• dep: python3-nose

  test discovery and running for Python3 unittest

• dep: python3-numpy (>= 1:1.20.0)

  Fast array facility to the Python language (Python 3)

• dep: python3-numpy-abi9

  виртуальный пакет, предоставляемый python3-numpy

Загрузка python3-pairtools

Загрузить для всех доступных архитектур

Архитектура	Версия	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
x32 (неофициальный перенос)	0.3.0-3.2+b1	121,6 Кб	405,0 Кб	[список файлов]