Пакет: python3-pairtools (0.3.0-3.2 и другие) [debports]
Ссылки для python3-pairtools
Ресурсы Debian:
Исходный код :
Не найденСопровождающие:
Внешние ресурсы:
- Сайт [github.com]
Подобные пакеты:
Framework to process sequencing data from a Hi-C experiment
Simple and fast command-line framework to process sequencing data from a Hi-C experiment.
Process pair-end sequence alignments and perform the following operations:
- Detect ligation junctions (a.k.a. Hi-C pairs) in aligned paired-end sequences of Hi-C DNA molecules - Sort .pairs files for downstream analyses - Detect, tag and remove PCR/optical duplicates - Generate extensive statistics of Hi-C datasets - Select Hi-C pairs given flexibly defined criteria - Restore .sam alignments from Hi-C pairs
Другие пакеты, относящиеся к python3-pairtools
|
|
|
|
-
- dep: cython3
- C-Extensions for Python 3
-
- dep: libc6 (>= 2.16)
- библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb
-
- dep: python3
- интерактивный высокоуровневый объектно-ориентированный язык (версия python3 по умолчанию)
- dep: python3 (<< 3.11)
- dep: python3 (>= 3.10~)
-
- dep: python3-click
- Command-Line Interface Creation Kit - Python 3.x
-
- dep: python3-nose
- test discovery and running for Python3 unittest
-
- dep: python3-numpy (>= 1:1.20.0)
- Fast array facility to the Python language (Python 3)
-
- dep: python3-numpy-abi9
- виртуальный пакет, предоставляемый python3-numpy
Загрузка python3-pairtools
Архитектура | Версия | Размер пакета | В установленном виде | Файлы |
---|---|---|---|---|
x32 (неофициальный перенос) | 0.3.0-3.2+b1 | 121,6 Кб | 405,0 Кб | [список файлов] |