Пакет: maq (0.7.1-10) [debports]

[ Источник:  ]

maps short fixed-length polymorphic DNA sequence reads to reference sequences

Maq (short for Mapping and Assembly with Quality) builds mapping assemblies from short reads generated by the next-generation sequencing machines. It was particularly designed for Illumina-Solexa 1G Genetic Analyzer, and has a preliminary functionality to handle ABI SOLiD data. Maq is previously known as mapass2.

Developmemt of Maq stopped in 2008. Its successors are BWA and SAMtools.

Другие пакеты, относящиеся к maq

• dep: libc6 (>= 2.38)

  библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0)

  вспомогательная библиотека GCC

• dep: libstdc++6 (>= 5)

  стандартная библиотека GNU C++ версии 3

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3)

  библиотека сжатия

• sug: bwa

  Burrows-Wheeler Aligner

• sug: samtools

  processing sequence alignments in SAM, BAM and CRAM formats

Загрузка maq

Загрузить для всех доступных архитектур

Архитектура	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
sparc64 (неофициальный перенос)	290,1 Кб	1 352,0 Кб	[список файлов]