Пакет: r-cran-phangorn (2.11.1+dfsg-1) [debports]

[ Источник:  ]

GNU R package for phylogenetic analysis

phangorn is a tool for reconstructing phylogenies, using distance-based methods, maximum parsimony or maximum likelihood, and performing Hadamard conjugation. It also offers functions for comparing trees, phylogenetic models or splits, simulating character data and performing congruence analysis.

Другие пакеты, относящиеся к r-cran-phangorn

• dep: libblas3

  реализация алгоритмов линейной алгебры — библиотека

  или libblas.so.3

  виртуальный пакет, предоставляемый libatlas3-base, libblas3, libblis4-openmp, libblis4-pthread, libblis4-serial, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial

• dep: libc6 (>= 2.36)

  библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.4)

  вспомогательная библиотека GCC

• dep: libstdc++6 (>= 11)

  стандартная библиотека GNU C++ версии 3

• dep: r-api-4.0

  виртуальный пакет, предоставляемый r-base-core

• dep: r-base-core (>= 4.2.2.20221110-2)

  GNU R core of statistical computation and graphics system

• dep: r-cran-ape (>= 5.6)

  GNU R package for Analyses of Phylogenetics and Evolution

• dep: r-cran-digest

  GNU R package for 'hash digest' of R data structures

• dep: r-cran-fastmatch

  GNU R package for fast match replacement for repeated look-ups

• dep: r-cran-generics

  GNU R common S3 generics not provided by base R methods

• dep: r-cran-igraph (>= 1.0)

  GNU R network analysis and visualization

• dep: r-cran-matrix

  GNU R package of classes for dense and sparse matrices

• dep: r-cran-quadprog

  GNU R package for solving quadratic programming problems

• dep: r-cran-rcpp

  GNU R package for Seamless R and C++ Integration

• rec: r-cran-tinytest

  Lightweight and Feature Complete Unit Testing Framework

• sug: r-bioc-biostrings

  GNU R string objects representing biological sequences

• sug: r-bioc-seqlogo

  GNU R sequence logos for DNA sequence alignments

• sug: r-cran-knitr

  GNU R package for dynamic report generation using Literate Programming

• sug: r-cran-magick

  advanced graphics and image-processing in GNU R

• sug: r-cran-rgl

  GNU R package for three-dimensional visualisation using OpenGL

• sug: r-cran-rmarkdown

  convert R markdown documents into a variety of formats

• sug: r-cran-seqinr

  GNU R biological sequences retrieval and analysis

• sug: r-cran-xtable

  GNU R coerce data to LaTeX and HTML tables

Загрузка r-cran-phangorn

Загрузить для всех доступных архитектур

Архитектура	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
sh4 (неофициальный перенос)	1 655,0 Кб	2 877,0 Кб	[список файлов]