Пакет: kissplice (2.2.1-1) [debports]
Ссылки для kissplice
Ресурсы Debian:
Исходный код :
Не найденСопровождающие:
Внешние ресурсы:
- Сайт [kissplice.prabi.fr]
Подобные пакеты:
Detection of various kinds of polymorphisms in RNA-seq data
KisSplice is a piece of software that enables the analysis of RNA-seq data with or without a reference genome. It is an exact local transcriptome assembler that allows one to identify SNPs, indels and alternative splicing events. It can deal with an arbitrary number of biological conditions, and will quantify each variant in each condition. It has been tested on Illumina datasets of up to 1G reads. Its memory consumption is around 5Gb for 100M reads.
Другие пакеты, относящиеся к kissplice
|
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.4)
- библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb
-
- dep: libgcc2 (>= 4.2.1)
- Пакет недоступен
-
- dep: libstdc++6 (>= 4.9)
- стандартная библиотека GNU C++ версии 3
-
- dep: python
- Пакет недоступен
-
- dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.4)
- библиотека сжатия
Загрузка kissplice
Архитектура | Размер пакета | В установленном виде | Файлы |
---|---|---|---|
m68k (неофициальный перенос) | 555,8 Кб | 1 120,0 Кб | [список файлов] |