Пакет: miniasm (0.3+dfsg-4) [debports]

[ Источник:  ]

ultrafast de novo assembler for long noisy DNA sequencing reads

Miniasm is an experimental very fast OLC-based de novo assembler for noisy long reads. It takes all-vs-all read self-mappings (typically by minimap) as input and outputs an assembly graph in the GFA format. Different from mainstream assemblers, miniasm does not have a consensus step. It simply concatenates pieces of read sequences to generate the final unitig sequences. Thus the per-base error rate is similar to the raw input reads.

Другие пакеты, относящиеся к miniasm

• dep: libc6.1 (>= 2.35)

  библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc6.1-udeb

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  библиотека сжатия

• rec: minimap

  tool for approximate mapping of long biosequences such as DNA reads

Загрузка miniasm

Загрузить для всех доступных архитектур

Архитектура	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
ia64 (неофициальный перенос)	38,2 Кб	113,0 Кб	[список файлов]