Пакет: pyensembl (2.3.13-1)

[ Источник: pyensembl  ]

installs data from the Ensembl genome database

The Ensembl genome database is an established reference for genomic sequences and their automated annotation. To have this data local has advantages for bulk analyses, e.g. for the mapping of reads from RNA-seq against the latest golden path - or a previous one to compare analyses.

This package provides a reproducible way to insatll this data and thus simplify the automation of respective workflows.

Другие пакеты, относящиеся к pyensembl

• dep: pylint

  Python 3 code static checker and UML diagram generator

• dep: python3

  интерактивный высокоуровневый объектно-ориентированный язык (версия python3 по умолчанию)

• dep: python3-datacache

  helpers for transparently downloading datasets

• dep: python3-gtfparse

  parser for gene transfer format (aka GFF2)

• dep: python3-memoized-property

  decorator to avoid redundant computation

• dep: python3-serializable

  base class with serialization methods

• dep: python3-typechecks

  express constraints on types

Загрузка pyensembl

Загрузить для всех доступных архитектур

Архитектура	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
all	35,8 Кб	206,0 Кб	[список файлов]