Пакет: python3-pairtools-examples (0.3.0-3.2 и другие) [debports]

[ Источник:  ]

Process sequencing data from a Hi-C experiment (examples)

Simple and fast command-line framework to process sequencing data from a Hi-C experiment.

Process pair-end sequence alignments and perform the following operations:

  - Detect ligation junctions (a.k.a. Hi-C pairs) in aligned paired-end
    sequences of Hi-C DNA molecules
  - Sort .pairs files for downstream analyses
  - Detect, tag and remove PCR/optical duplicates
  - Generate extensive statistics of Hi-C datasets
  - Select Hi-C pairs given flexibly defined criteria
  - Restore .sam alignments from Hi-C pairs

This package contains some examples

Другие пакеты, относящиеся к python3-pairtools-examples

• enh: python3-pairtools

  Framework to process sequencing data from a Hi-C experiment

Загрузка python3-pairtools-examples

Загрузить для всех доступных архитектур

Архитектура	Версия	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
hppa (неофициальный перенос)	0.3.0-3.2+b2	12,1 Кб	50,0 Кб	[список файлов]