Пакет: ncbi-entrez-direct (19.2.20230331+dfsg-3 и другие)

[ Источник: ncbi-entrez-direct  ]

NCBI Entrez utilities on the command line

Entrez Direct (EDirect) is an advanced method for accessing NCBI's set of interconnected databases (publication, sequence, structure, gene, variation, expression, etc.) from a terminal window or script. Functions take search terms from command-line arguments. Individual operations are combined to build multi-step queries. Record retrieval and formatting normally complete the process.

EDirect also provides an argument-driven function that simplifies the extraction of data from document summaries or other results that are returned in structured XML format. This can eliminate the need for writing custom software to answer ad hoc questions. Queries can move seamlessly between EDirect commands and UNIX utilities or scripts to perform actions that cannot be accomplished entirely within Entrez.

Другие пакеты, относящиеся к ncbi-entrez-direct

• dep: curl

  передача данных с синтаксисом URL, инструмент командной строки

  или wget

  загрузка файлов из сети

• dep: libc6 (>= 2.34)

  библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb

• rec: python3

  интерактивный высокоуровневый объектно-ориентированный язык (версия python3 по умолчанию)

• sug: curl

  передача данных с синтаксисом URL, инструмент командной строки

• sug: libxml-simple-perl

  Perl module for reading and writing XML

• sug: libxml2-utils

  GNOME XML library - utilities

• sug: perl

  практический язык Ларри Уолла для извлечения данных и составления отчётов

• sug: unzip

  распаковщик файлов .zip

Загрузка ncbi-entrez-direct

Загрузить для всех доступных архитектур

Архитектура	Версия	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
armel	19.2.20230331+dfsg-3+b3	5 354,2 Кб	26 174,0 Кб	[список файлов]