Пакет: cd-hit (4.8.1-4)

[ Источник: cd-hit  ]

suite of programs designed to quickly group sequences

cd-hit contains a number of programs designed to quickly group sequences. cd-hit groups proteins into clusters that meet a user-defined similarity threshold. cd-hit-est is similar to cd-hit, but designed to group nucleotide sequences (without introns). cd-hit-est-2d is similar to cd-hit-2d but designed to compare two nucleotide datasets. A number of other related programs are also in this package. Please see the cd-hit user manual, also part of this package, for further information.

Теги: Область: Биология, Биоинформатика, Реализовано на: implemented-in::c++, implemented-in::perl, Пользовательский интерфейс: Командная строка, Роль: role::program, use::comparing, Работает с: Биологические последовательности

Другие пакеты, относящиеся к cd-hit

• dep: libc6 (>= 2.7)

  библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.5)

  вспомогательная библиотека GCC

• dep: libgomp1 (>= 6)

  вспомогательная библиотека GCC OpenMP (GOMP)

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  стандартная библиотека GNU C++ версии 3

• dep: perl

  практический язык Ларри Уолла для извлечения данных и составления отчётов

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  библиотека сжатия

Загрузка cd-hit

Загрузить для всех доступных архитектур

Архитектура	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
armel	491,0 Кб	1 319,0 Кб	[список файлов]